Seghedin şi împrejurimile au fost locuite încă din epoca nouă a pietrei fiind o zonă importantă între Dacia şi Pannonia. După unele opinii însuşi Attila s-a stabilit o vreme în regiunea aceasta.

În anul 1183 are loc prima menţionare a denumirii oraşului într-un izvor scris în care se vorbeţte de transportul pe apă al sări, pe Mureş, acest fapt ajutând la dezvoltarea localităţii. În vremea atacurilor tătarilor, locuitorii se ascundeau prin mlaştinile din apropiere apoi se întorceau şi îşi reconstruiau oraşul distrus. În anul 1522 oraşul Seghedin avea 7000 de locuitori iar în 1525-1526 turcii au cotropit oraşul. Locuitorii importanţi ai oraşului s-au mutat din oraş din această cauză. Cu această ocazie a început şi popularea oraşului cu străini printre ei numărându-se turci, slavi din sud, raguzini.

În 1715 oraşul şi-a recăpătat rangul de oraş regal pe care-l are şi până în zilele noastre. După 1723 Seghedinul a cunoscut o dezvoltare mare, printre altele construindu-se şi un gimnaziu iar în 1869 s-a deschis aici magazinul lui Pick Márk, predecesorul renumitei Fabrici de Salam Pick.

În anul 1879, marile inundaţii au distrus oraşul. Cinci mii şase sute de case au fost distruse, au murit 165 de oameni, 60 000 de oameni au fost strămutaţi doar 10 000 de locuitori au mai rămas în oraş. Atunci Franz Iosif a promis că va reconstrui oraşul şi că va fi mai frumos ca niciodată. Proimisiunea lui a fost respectată şi în câţiva ani Seghedinul a fost reconstruit. Oraşul modern de astăzi este cel mai frumos şi cel mai ordonat oraş maghiar.